Het reisverhaal van Bontekoe is al eeuwenlang populair.
In eerste instantie werd steeds het journaal op nieuw uitgebracht en hertaald. Dit journaal heeft ook diverse schrijvers en historisie geinspireerd. Denk aan het minder bekende boek van Leopold Vermeiren met de titel: Bontekoe en het brandende schip. Of de bekendere gedichten bundel van E. J. Potgieter. Het meeste bekend is hij toch wel geworden met het boek "De Scheepsjongens van Bontekoe" van Johan Fabricius. Opmerkelijk is dat Bontekoe hierin niet zelf centraal staat, maar een aantal scheepsjongens die aanmonsterden aan zijn schip.

De naam van het boek zegt het al: "Scheepsjongens van Bontekoe" is het avontuur verteld vanuit de ogen van de drie scheepsjongens: Hajo, Rolf een neef van Bontekoe, en Padde. De jongens gaan met het schip "De Nieuwhoorn", onder bevel van schipper Bontekoe, in 1618 naar de Oost Indiï. Rolf was een neef van Bontekoe. Hajo had als grootste wens, een keer mee te varen. Maar het was niet de bedoeling dat Padde mee zou gaan. Padde viel per ongeluk in slaap op de boot en werd wakker toen het al te laat was. Padde werd botteliermaat op het schip met de inetie om hem terug te sturen als ze een schip richting Nederland tegen zouden komen.Het eerste gedeelte van de reis ging vrij voorspoedig, en raakten ze onder andere bevriend met Harmen, de koksmaat. Toch hebben ze al heel wat meegemaakt zoals wat de iedereen meemaakte die zo'n reis ondernam: storm, windstiltes, scheurbuik, alvorens dat per ongeluk het buiskruit ontplofte. Niet ver van Sumatra lijden ze schipbreuk. De overlevenden zitten opgepropt in de sloepen en de voorraad proviand raakt al gauw op, en na verloop van tijd beginnen de hongerige overlevenden zelfs te overwegen om één van de jongens te doden en op te eten. Maar gelukkig is "als de nood het hoogst is, de redding nabij". Er komt land in zicht en blijken Sumatra te hebben bereikt. De jongens raken het het contact met de rest kwijt en beleven afzonderlijk van de rest vele spannende avonturen. Uiteindelijk weten ze op een vlot Java te bereiken waar ze de rest van de bemanning, inclusief schipper Bontekoe, weer terug weten te vinden. Ze keerde niet met Bontekoe terug naar Nederland omdat hij daar nog een tijd zou blijven om de varen naar onder andere China. Rolf bleef bij zijn oom in Indië. Harmen, Hajo en Padde monsterden aan op het schip de "Berger Boot" en komen uiteindelijk veilig thuis en kunnen hun schaatsen weer onderbinden. Wat een tegenstelling met de tropen.

Het Journaal is ook veel gebruikt voor educatie doeleinden, ter illustratie hoe het in die tijd er aan toe ging. Voorbeeld: Bostoen